上海市属重点高校在推进“211工程”建设中超常规发展。上海大学自1996年通过国家“211工程”部门预审后，市政府统筹规划，把学校由原合并之初的分散状态融合成一个学科齐全、综合优势明显、办学特色鲜明的高水平大学。上海第二医科大学经过5年多的建设，学科建设更趋完善，综合优势和特色更加凸现，列入“211工程”重点学科建设的血液学、内分泌代谢病学、消化系统病学等9个学科全部达到国内先进水平，部分达到国内领先或国际先进水平。
　　
　　在上海市委、市政府的关心和支持下，市属重点高校主动适应上海经济发展的需要，勇于创新，敢于改革，呈现出超常规发展的态势。上大学科建设选择了抓重点、抓突破、抓制高点的发展策略，在信息、新材料、机电一体化等对上海经济渗透力强的技术领域和应用数学、力学等基础理论研究方面取得了令人瞩目的成果，新增教育部重点学科2个，上海市“重中之重”学科1个，市重点学科3个，市教委重点学科19个，还新增博士点7个和博士后流动站3个，培育了一批有鲜明特色和较好发展前景的学科新生长点。上海二医大目前拥有6个国家级重点学科，7个上海市重点学科（其中2个是市“重中之重”学科），10个市医学领先专业重点学科，为完善教学研究型医科大学的格局，增强学校参与国际竞争的综合能力奠定了基础。
　　
　　上海市属重点高校还努力创造优越环境，吸引和造就一批优秀的学科、学术带头人，师资队伍整体素质有了明显提高。上海二医大以创新思路大胆引进海外顶尖人才，加大人才培养力度，一批在国内外有影响的学科带头人和优秀中青年骨干脱颖而出。该校现有中科院、工程院院士5人，国家“973”项目首席科学家3人，“长江特聘讲座教授”1人，“长江特聘教授”4人，国家杰出青年基金获得者7人。
　　
　　“211工程”重点建设开展以来，上海市属重点高校积极构建政府、企业和学校多元化投资开发体系，推动学校科研与开发水平不断攀高。上大“211工程”建设以来的科研总经费保持在全国高校前20名，2001年的科研经费达2.15亿元，承担了一大批国家自然科学基金和“863计划”等国家级项目，论著和其它学术成果在量上有较大增长，在质上有明显的提高，2001年SCI论文数达140篇，在全国高校中排名第24位；校园建设与改造力度前所未有，完成投资14.64亿元的新校区已成为全国最富有现代气息的大学园区之一，学校整体水平已经跨入国内先进高校行列。