上海交大确立本科教学是“立校之本”的办学理念，不断推进教学改革，提高教学质量。：
　　1、自觉调整专业设置、自主设置新专业。如电信学院与电力学院合并成电信与电气工程学院，动力学院与机械学院合并成机械与动力工程学院；根据办学实力、社会需求，新设置了软件工程、信息安全工程、光通信工程以及临床医学工程等四门专业。在学生学习上，构造正三角形的知识结构即公共基础知识课程、专业基础知识课程、专业课程三个知识层次，以夯实基储拓展专业知识面，使学生就业时，不受用人单位过细专业要求所限制。
　　2、积极推进学分制改革。让学生有选时、选师、选课、选科的自由，鼓励学有余力的学生选修双学位；实行考教分离，促使教师认真备课、更新内容、教学相长。在第一轮学分制改革中，就有7位教师8个人次因落聘而未能按时上岗执教。
　　3、构建创新人才培养体系。该校大力增加实验课时，集中财力、物力和人力建设好电子电工、基础物理、基础化学、生物技术、机电一体化、基础力学等10个门类学科的公共实验平台，创建全国第一个大学生工程训练中心，积极鼓励学生自己设计实验题目、教师个性化的指导实验，有效地改变了重理论、轻实践的教学思想与方法；加大学生参加社会实践、科技创新和创业实践的力度，并将就业实习与就业紧紧相连。
　　4、加速人才培养的国际化进程。如机械与动力学院和美国密西根大学合作共建机械学院、材料科学与工程学院和英国伦敦大学玛利皇后学院合作、管理学院分别与加拿大哥伦比亚大学、美国康奈尔大学合作、计算机系与澳大利亚悉尼大学合作等已成为国际化办学的典范。