水环境质量方面，2012年，“六江两溪”水质总体保持优良，水域功能达标率、Ⅰ类－Ⅲ类水质比例和交界断面达标率分别为97.7%、94.7%和97.6%，但闽清下西园、长泰洛宾、南靖靖城桥、平和汤坑桥、新罗区顶坊交界断面未达到考核标准。此外，漳州九龙江河口和浦南、三明水汾桥、龙岩西陂、宁德双口渡（霍口）等交界断面，福州的闽江、敖江支流，南平的闽江支流，漳州和龙岩的九龙江支流，水质出现不同程度的超标。
饮用水源方面，福建全省设区城市、县级市和县城集中式饮用水源水质达标率分别为100%、99.2%与98.9%，清流县饮用水源水质出现超标。
水污染物总量控制方面，得分靠前的为厦门、泉州、龙岩，得分靠后的为漳州、莆田。（记者 潘园园）
