闽台农业合作虽取得一些成效，但在发展过程中也遇到一些困难与问题，主要有：投入力度仍显不足、优惠政策落实不够到位、支持措施还不够有力。
建议国家有关部委在筹划两岸农业合作时，对福建予以特殊考虑，在政策、项目、资金、资源等方面予以倾斜。扩大海峡两岸农业合作专项资金规模。
继续支持海峡两岸农业合作试验区建设，特别在试验区基础设施建设项目、台湾农民创业园建设项目、台湾农业良种繁育与技术引进推广项目、两岸合作农产品加工出口基地建设项目、两岸农民专业合作组织试点项目等给予重点扶持。同时，设立两岸农业合作基建项目，特别是在利用扩大内需的盘子中，专列对台农业合作基础建设项目，支持福建的对台农业合作。出台海峡两岸（福建）农业合作试验区优惠政策及实施细则。（本网记者 郑昭 潘绣文）
