环境污染治理是城市环境保护的首要任务。为此，“十五”期间上海从工业污染整治、固体废物处置和利用等重点领域着手，以重点项目、重点地区为突破口，加强源头控制，实施全覆盖的污染整治措施。
　　据统计：“十五”期间，上海的城市废水排放被有效地控制在20亿吨以内，2005年达到最高值为19.97亿吨，仅比2000年增长5.2%，其中工业废水排放逐年减少为5.11亿吨，占25.6%；生活废水排放逐年增加为14.86亿吨，占74.4%。
　　上海的烟尘排放量呈逐年下降的趋势，2005年，烟尘排放总量比2000年下降18.4%。工业粉尘排放也得到有效的控制，2005年比2000年下降60.6%，为“十五”时期的最低。但工业废气排放出现了增加趋势，5年废气排放总量增长了42.3%，2005年为9103亿标立方米，其中工业废气排放占93.2%。
　　“十五”期间，上海以循环经济和清洁生产为发展方向，在加强工业废弃物处理的同时，更注重废弃物的循环再利用，不断提高综合利用能力。上海工业废水重复利用率逐年上升，2005年达58.1%，比2000年上升7.7个百分点；工业固体废物综合利用率保持在96%以上，2005年达96.3%；2005年，“三废”综合利用产品产值达到9.11亿元，5年累计达41.53亿元。
　　“十五”期间，上海完成工业污染治理项目953项，累计投资20.06亿元。2005年，工业企业拥有1707套废水治理设施，日处理能力达501万吨，工业废水排放达标率为97.05%；万元GDP废水化学需氧量排放量大幅下降，2005年为4吨，比2000年下降72.5%。